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pcvolkmer/README.md

Modellvorhaben Genomsequenzierung gem. §64e SGB V

Bibliotheken für das Modellvorhaben §64e SGB V

DNPM:DIP (MV §64e) MTB DTOs basierend auf dem DNPM Datenmodell Version 2.1

Die MTB DTO Projekte sind hierhin umgezogen: DNPM:DIP.

Language/Platform Test example JSON
Java (JDK 11 based, uses java.util.Date and Project Lombok) Run Tests
.NET (.NET Standard 2.0, uses NewtonSoft.Json) Run Tests
Go Run Tests
Rust Run Tests

Getestet wurde jeweils für die hier beschriebenen synthetischen JSON Daten.

Siehe auch: KohlbacherLab/DNPM:DIP-API-Gateway

DNPM:DIP (MV §64e) Rare Disease DTOs basierend auf dem Datenmodell SE:dip

Language/Platform Test example JSON
Java (JDK 11 based, uses java.util.Date) Run Tests
.NET (.NET Standard 2.0, uses NewtonSoft.Json) Run Tests

Genomrechenzentrum-Metadaten (MV §64e) DTOs basierend auf dem GRZ Metadaten-Schema 1.3.0

Language/Platform Test example JSON
Java (JDK 11 based, uses java.util.Date) Run Tests
.NET (.NET Standard 2.0, uses NewtonSoft.Json) Run Tests
Go Run Tests
Rust Run Tests
GRZ-Metadaten Teil "Files" mit "FASTQ-Tools"

Siehe: https://github.com/pcvolkmer/fastq-tools?tab=readme-ov-file#grz-metadata

Bash-Script für GRZ-Metadaten Teil "Files"

Siehe: https://gist.github.com/pcvolkmer/35e397ab7a2ca28a203842bd49b14aaf

Alle Projekte

Eine Übersicht über alle Projekte gibt es hier: https://github.com/pcvolkmer?tab=repositories

Pinned Loading

  1. docker-jenkins-slave-nodejs docker-jenkins-slave-nodejs Public

    Simple Dockerfiles to build a Jenkins slave for Node.js

    Dockerfile 7 3

  2. mv64e-onkostar-data mv64e-onkostar-data Public

    Ziel dieser Library ist die Bereitstellung von Methoden zum Laden von Daten der DNPM-Formulare aus der Onkostar-Datenbank und dem Mapping in das DNPM-Datenmodell 2.1

    Java 3 1

  3. onkostar-plugin-dnpm onkostar-plugin-dnpm Public

    Onkostar-Plugin zur Verwendung mit der DNPM-Formularsammlung

    Java 2 1

  4. dnpmdip-devenv dnpmdip-devenv Public

    Simplified docker based DNPM:DIP environment for development purposes

    1

  5. mv64e-etl-processor mv64e-etl-processor Public

    Diese Anwendung pseudonymisiert/anonymisiert Daten im DNPM-Datenmodell 2.1 unter Beachtung des Consents und sendet sie an DNPM:DIP

    Kotlin 1 4

  6. mv64e-onkostar-plugin-export mv64e-onkostar-plugin-export Public

    OS Export-Plugin für das DNPM-Datenmodell 2.1

    Java 1 1