fix: 修复参考文献收集失败、编号错乱与标题/条目格式问题

[hailuohl]

问题

UserOutput 的参考文献链路存在四个问题，导致生成的 res.md 参考文献一节为空或格式损坏：

1. 引用永远收集失败：writer 提示词规定引用格式为 {[^1] 完整引用信息}（无冒号），而 replace_references_with_uuid 的正则要求 {[^1]: 引用信息}（带冒号），两者从未对齐。模型按提示词输出时正则匹配不到，引用原样残留在正文里，参考文献节只剩空标题。
2. 重复引用编号错乱：同一文献在多个章节被引用时，sort_text_with_footnotes 每次都递增 ref_index，正文出现 [2] 但参考文献列表只有 [1]。
3. 正文引用标记用了脚注语法 [^n]：不支持脚注的 markdown 渲染器直接丢字面量；支持脚注的渲染器把文献内容渲染成页脚脚注，而不是集中的参考文献节。
4. 标题带行首空格：" ## 参考文献" 在严格渲染器（如 pandoc）中不识别为标题，输出字面 ## 参考文献 文本。

修复

• replace_references_with_uuid 正则冒号改为可选，兼容 {[^1]: …} 与 {[^1] …} 两种写法
• writer 提示词同步明确为带冒号格式并给出完整示例
• 重复引用复用首个编号
• 正文引用标记由 [^n] 改为普通 [n] 文本；文末条目由 [^n]: 脚注定义 改为 [n] 文本
• 参考文献标题去掉行首空格

效果对比

同一输入（两处引用同一篇文献，一处带冒号一处不带）走 get_result_to_save()：

-抽样检验采用精确概率枚举{[^1] 张三. 抽样检验研究[J]. 统计, 2024.}完成方案设计。
-求解过程沿用该文献[^1]的框架。
- ## 参考文献
-[^1]: 张三. 抽样检验研究[J]. 统计, 2024
+抽样检验采用精确概率枚举[1]完成方案设计。
+求解过程沿用该文献[1]的框架。
+# 参考文献
+[1] 张三. 抽样检验研究[J]. 统计, 2024

测试

新增 app/tests/test_user_output.py（上游此前无该模块测试），覆盖上述四个场景——在 main 上 4 例全部失败，本分支全部通过。

验证：uv run python -m unittest app.tests.test_user_output